党政群团机构

党委办公室、学校办公室、国际交流与合作办公室、党委组织部、党委宣传部、发展规划处、纪委办公室、监察处、学生工作部（处）、保卫处（武装部）、人事处、教务处、科技处、医院管理处、社会合作与产业开发处、离退休干部工作处、财务与资产管理处、审计处、设备管理处、后勤基建管理处、工会、团委

教学机构

研究生学院、基础医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、第三临床医学院、医学检验学院、护理学院、药学院、公共卫生学院、人文与管理学院、信息工程学院、外国语学院、继续教育学院、马克思主义学院、体育教学部

教辅科研机构

图书馆、教育技术与信息中心、学报编辑部、实验动物中心、教师教学发展中心、湛江校区科研管理中心、东莞校区科研管理中心、生命文化研究院、养老产业研究院、

附属机构

附属医院、第二附属医院、招投标中心